在初版《混沌头脑》发售的2008年,以“恋爱”、“催泪”为主题的市场已经趋近饱和。而《混沌头脑:诺亚》围绕日常行为中产生的“妄想”展开,将可爱的美少女游戏与血腥的心理恐怖小说有机地结合起来,形成引人注目的巨大反差,又导入了独自的理论与近似科学的视点,使得作品保持了一定的真实感,能够带来更多的刺激与乐趣。
高中私立翠明学园二年级学生的西条拓巳,自称对三次元没有兴趣,和家里的大量美少女人偶一起生活。在他所住的涩谷在2008年9月7日以来发生了连续猎奇杀人事件“新世代的疯狂(ニュージェネレーションの狂気)”,成为了网络和电视上的热门话题。2008年9月28日深夜,拓巳在聊天室遇到了一个自称“将军”的人。“将军”发言中的URL链接到像是预言下一个猎奇事件的恐怖图像。第二天,拓巳遇到了和图像中的手法一样的杀人现场。在尸体前站着浑身是血的少女,咲畑梨深。
5pb.(原KID)在家用游戏主机上发布过《秋之回忆》等知名作品,Nitro+则专注于PC游戏,业内闻名的《沙耶之歌》便是出自其手。本篇作为5pb.和Nitro+共同制作的第一部作品,创作班底包括了人设“ささきむつみ”和插画“CHOCO”等知名成员,由音乐制作小组“ZIZZ STUDIO”,以及音乐创作人志仓千代丸创作剧中音乐烘托游戏的气氛。
游戏中设计了独特的“妄想触发器(妄想トリガー)”系统,这代替了通常的路线选择,绿色为积极妄想,红色为消极妄想,也可以选择不进行妄想。根据玩家的选择,妄想的暴走可能会被触发,其结果将对故事的后续发展带来影响。产生出的“妄想”有时会带来意想不到的效果,比如有平时绝不敢对女孩子做的拥抱、接吻、透视等行为。
各种似曾相识的地名和仿拟名词在作品中随处可见,使其带有ARG的风格。这样既淡化了现实与虚构的界限,又令玩家不时会心一笑,乐于参加圣地巡礼以获得新的体验。